儿童大动脉转位常伴有肺动脉高压、心力衰竭、栓塞等疾病。
肺动脉高压：肺动脉高压是指静息时肺动脉平均压>；3.33kPa(25mmHg)或运动时>；4kPa(30mmHg)人。肺动脉高压的预后取决于潜在疾病的成功治疗。一般来说，原发性肺动脉高压的预后较差，从诊断开始，生存时间不到3年。然而，也有关于钙通道阻滞剂和前沿环素治疗的报告。目前，内皮素拮抗剂的经验太少，无法得出生存改善的结论。除非移植，否则患者最终可能死于恶化的右心力衰竭。继发性肺动脉高压主要与先天性心脏病有关，原发性肺动脉高压的原因尚不清楚。先天性心脏病的发生是各种因素的综合结果。为预防先天性心脏病的发生，应开展科普知识的宣传教育，重点监测适龄人群，充分发挥医务人员、孕妇及其家属的作用。
心力衰竭：心力衰竭不是一种独立的疾病，而是指由各种原因引起的心脏病的严重阶段。发病率高，五年的存活率与恶性肿瘤相似。心力衰竭是由于初始心肌损伤和应力：包括收缩期或舒张期心室负荷和（或）心肌细胞数量和质量的变化（心肌梗死、心肌炎等弥漫性），导致心室和（或心肥大和扩张（心室重塑，remodel-ing人继以心室舒缩功能低下，逐渐发展而成。
