血栓形成常继发于：①肝硬化或肝外压迫导致门静脉充血和血流滞；②坏疽阑尾炎、溃疡性结肠炎、绞窄性疝等腹腔化脓性感染；③有些血液异常，如真性红细胞增多症、口服避孕药引起的高凝状态；④肠系膜血肿、脾切除术、右半结肠切除术等外伤或手术损伤。约1/4的患者没有明显的诱因，称为原发性肠系膜静脉血栓形成。
脉血栓形成后，它可以继续扩散到近端和远端。当曲静脉回流完全阻塞时，肠道充血水肿，浆膜下点出血，然后扩散成片。肠壁和肠系膜增厚，水肿。然后，肠曲出血性梗死，呈深紫色。
大量血液从肠壁和肠系膜渗入肠腔和腹腔。静脉急性闭塞也可反射性引起内脏动脉痉挛和血栓形成，加速肠坏死的过程。最后，它还会导致低血容量和中毒性休克。
