1.呼吸道并发症
约在10％吸入性肺炎、支气管扩张、肺脓肿和肺纤维化是儿童最常见的病人。吸入非典型分枝杆菌和食道中滞留的油可诱发慢性肺部变化，如临床和X结核病。痰中发现抗酸菌，可能是非典型分枝杆菌，不要误以为结核杆菌。
2、癌肿
据报道2％～7％患者可合并食管癌，特别是病程10年以上、食管扩张明显、滞留严重的患者。主要是由食物潴留引起的慢性炎症刺激因素引起的。食管肌层切开或扩张术后不能预防癌症的发生，手术成功后多年仍可发生癌症。因此，应仔细观察是否有并发性食管癌，在可疑情况下，进行活体组织学检查。黄国军和张伟分别报道，食管癌患者的性别发病率与食管癌相似，主要是男性，但癌症并发性放松的发病年龄小于食管癌患者。患有放松症的患者的平均年龄为48～51岁，无失弛缓症患者的年龄62～67岁。肿瘤多见于食管中段，其次是食管下段和上段。
3、食管炎
由于食管内食物潴留，内镜检查可见食管炎及其粘膜溃疡、溃疡可出血、少数自发穿孔、食管气管瘘。那些身体虚弱或接受过抗生素治疗或粒细胞减少的人可能会感染念珠菌。内镜检查显示炎症粘膜上的白斑。可以诊断为标本涂片和活检。治疗应首先扩张以消除食管潴留，病情不能忍受强扩张可以吸引排水以保持食管排空，同时使用抗生素。
4.其他并发症
由于食道扩张，管腔张力增加，膈膜扩张型憩室并发症可同时治疗。少数患者有类似类风湿性关节炎的关节并发症，治疗后症状可缓解。
