应用神经内镜治疗脑积水的手术还包括导水管成形术、透明隔造瘘、脉络丛烧灼术、不对称脑积水和脑室脑池内囊肿引起的继发性脑积水内分流术。这种方法是一种根治性方法，可以有效避免分流引起的并发症。一旦成功，患者将终身受益。婴儿脑积水手术应从创伤最小的手术开始。手术的关键是根据脑积水的原因选择手术方法。建议先选择软神经电子室内镜、软神经电子脑内镜下行中脑导水管狭窄扩张术或中脑导水管支架植入术，即中脑导水管畅通，解决脑积水问题，或进行第三脑室底造瘘或蛛网膜囊肿。对于交通脑积水或脑室镜下内引流无效的儿童，只能通过脑室腹腔分流术解除脑积水。
有时，当孩子去看医生时，脑积水非常严重，导致大脑的本质部分非常薄。此时，普通分流的风险相当大，容易导致颅内出血、残疾甚至死亡。因此，应使用可调压分流系统进行手术，以避免术后并发症。
