由于小肠憩室开口大，引流好，常无症状，空肠憩室约60％无症状，多发现在行上消化道造影中。有时可表现为轻度消化不良、恶心、上腹部不适、饭后胀满、肠鸣或胀气，但这些都不是特殊症状。小肠憩室通常在并发症发生后被诊断出来。睡室并发症包括睡室炎、出血、穿孔或梗阻；特别是空肠憩室可导致盲环综合征、吸收障碍和巨细胞性贫血。
憩室炎通常是由异物或结石引起的，可能是急性发作，但很少被诊断出来。穿孔较少，最后一段回肠憩室穿孔可误诊为阑尾穿孔，穿孔后可形成局限性脓肿、肠瘘或弥漫性腹膜炎。出血是一种更常见的并发症。大多数是少量的慢性出血，反复发作的大出血很少，通常需要紧急手术。但它通常被误认为是溃疡性出血。术中检查应注意寻找是否有小肠憩室，并仔细确定出血的来源。结合肠梗阻时，有阵发性腹绞痛等症状。肠梗阻可由睡室所在的肠环扭转和折叠引起，睡室成为折叠的起始部分，也可由穿孔后形成的炎性粘连引起，通常需要手术治疗。此外，还有关于气囊肿和恶性变化的报告。
小肠憩室病还可引起盲环综合征、吸收障碍、慢性腹泻、脂肪腹泻、贫血、营养不良、体重减轻等。有报道称，小肠憩室病吸收不良综合征的发病率高达50％。当正常人空腹时，空肠是无菌的。在空肠憩室疾病中，可培养多种细菌。当小肠正常蠕动受到干扰时，食物停滞，不能快速移动到远处，肠道细菌就会繁殖；憩室内容物流动性差，侵蚀积累和腐败，为细菌增殖提供了良好的条件。小肠细菌过度繁殖可产生慢性腹泻、脂肪腹泻、吸收障碍、营养不良、贫血等。脂肪腹泻主要与胆汁盐有关。增殖的细菌几乎可以将所有的胆汁盐分解成非胆汁盐，缺乏胆汁盐，脂肪不能形成一个小的橡胶颗粒状态，脂肪只能溶解在水中，很容易被小肠绒毛覆盖，吸收到上皮细胞。非结合胆汁盐对脂肪没有这种影响，使脂肪不能被吸收和产生脂肪腹泻。同时，细菌作用于脂肪酸的产物也会导致患者水腹泻、水和电解质代谢紊乱，部分慢性腹泻患者，可表现出周围神经症状或肌肉疾病。它还干扰碳水化合物的正常代谢，影响蛋白质的吸收，或者细菌使用食物中的蛋白质，因此患者可以合并低蛋白血症。细菌的过度生长也会影响维生素的吸收，特别是维生素B12。维生素B12肠粘膜的吸收功能可能不受细菌毒素的抑制，而是维生素B12它们都被细菌利用。一些实验研究表明，即使是维生素B12与内因子结合时，细菌也可以竞争和夺取维生素B12。因此，小肠憩室病可合并巨幼红细胞性贫血。
本病临床症状缺乏特异性。60～80弱老年人，长期消化功能障碍，常有胃肠胀气、胃隐痛或痉挛性疼痛，或腹泻、巨幼红细胞性贫血应考虑该疾病的可能性。上消化道气钡造影表明，小肠膜侧有圆形或卵圆形，边缘整齐光滑的袋状阴影，或更大的睡室腔显示气体、液体和钡的三层平面，可以明确诊断。对于疑似消化道出血的患者，核素检查和选择性肠膜上动脉造影可以帮助诊断。
