由于小肠憩室开口大，引流好，常无症状，空肠憩室约60％无症状，多在行上消化道造影中发现，有时可表现为轻度消化不良、恶心、上腹部不适、饭后胀满、肠鸣或胀气，但这不是特殊症状，常在并发症后诊断为小肠憩室，并发症有憩室炎、出血、穿孔或梗阻；特别是空肠憩室，可导致盲环综合征、吸收障碍和巨细胞性贫血。
憩室炎常由异物或结石引起，可有急性发作，但很少诊断，穿孔罕见，最后一段回肠憩室穿孔可误诊为阑尾穿孔，穿孔后可形成局限性脓肿、肠瘘或弥漫性腹膜炎，出血是更常见的并发症，多为少量慢性出血，反复大出血罕见，常需急性手术，但常误诊为溃疡性出血，术中检查应注意寻找是否有小肠憩室，仔细确定出血的来源，结合肠梗阻时有阵发性腹绞痛等症状，肠梗阻可由憩室所在的肠环扭转、折叠、折叠、折叠、折叠、折叠、穿孔后形成炎性粘连，也常需手术治疗，此外，休息室还有气囊肿、恶性变化的报告。
小肠憩室病也可引起盲环综合征，有吸收障碍、慢性腹泻、脂肪性腹泻、贫血、营养不良、体重下降等小肠憩室病吸收不良综合征的发病率高达50％，正常人空腹时，空肠是无菌的，而在空肠憩室病时，可培养出多种细菌，当小肠正常的蠕动受到干扰时，食物停滞，不能向远侧快速持续移动，肠内细菌就会繁殖；憩室内容物的流动性也差、食糜积存、腐败，为细菌增殖提供了良好条件，小肠内细菌过度繁殖就可产生慢性腹泻、脂肪泻、吸收障碍、营养不良，贫血等，发生脂肪泻主要与胆盐有关，增殖的细菌几乎可将全部肠内的结合胆盐分解成非结合胆盐，缺乏结合胆盐，脂类不能形成细小的微胶粒状态，而脂肪只有形成微胶粒才能溶于水，才容易被小肠绒毛络住，吸收入上皮细胞，非结合胆盐对脂肪没有这种作用，使脂肪不能被吸收而产生脂肪泻，同时，细菌对脂肪酸作用的产物还可造成病人水泻，发生水和电解质的代谢紊乱，一部分慢性腹泻病人，可表现出周围神经症状或合并肌病，小肠内细菌的过度繁殖也会干扰碳水化合物的正常代谢，影响蛋白质的吸收，或者细菌在食物中使用蛋白质，因此患者可以合并低蛋白血症，细菌的过度生长也会影响维生素的吸收，特别是维生素B12，维生素B12肠粘膜的吸收功能可能不受细菌毒素的抑制，而是维生素B12一些实验研究表明，即使是维生素也被细菌利用B12细菌也可以与内因子竞争，夺取维生素B12，因此，小肠憩室病可合并巨幼红细胞性贫血。
