除了一般疾病的鉴别外，本病在临床上主要需要与以下疾病不同：
1.脊髓型颈椎病 在患者进行详细的临床和影像学检查之前很容易混淆两者。然而，如果你能想到这种疾病，并在颈椎上摄入动力片，就不难识别它。
2.椎动脉型颈椎病 两者引起完全相同的临床症状，可借助X线片、CT或MRI如有必要，应进行椎动脉造影或检查MRA判断检查等。
3.偏头痛 枕颈不稳定时，第一颈神经受累引起头后剧烈疼痛，容易误诊为偏头痛。此时，枕大神经封闭疗法除了可以根据各自的临床特点进行鉴别外，还有助于鉴别诊断。
4.颈部肿瘤 椎骨肿瘤容易发现，但椎管内的肿瘤，特别是枕骨孔附近的肿瘤，容易漏诊。十多年前，作者(MRI出现在前几年)有4例脊髓造影阴性，实际上是这里的肿瘤。因此，任何怀疑这种情况的人都可以尽快进行MRI对早期诊断有帮助。
5.其它 还应与颈型颈椎病、颈背筋膜纤维织炎、颈部扭伤相鉴别。
