治疗新型隐球菌性脑膜炎时，常用以下药物：
两性霉素B
两性霉素B是目前公认的首选药物，可与真菌细胞膜上的麦角甾醇结合，增加细胞膜的渗透性，使细菌内的物质渗出，导致真菌死亡。
2、氟康唑
氟康唑抑制细胞色素P依赖酶可以抑制细胞膜麦角甾醇的生物合成，起到杀菌作用。这种药可以口服或静脉滴注，每天200mg～400mg。
三、五氟胞嘧啶
阻断核酸合成，抑制真菌生长。
一旦确诊，应立即进行抗真菌治疗。此外，甘露醇和呋塞米(速尿)等脱水剂应用于颅内压升高的患者。手术切除可考虑颅内脓肿或肉芽肿。脑脊液分流术可用于严重脑积水，加强全身营养支持治疗。
