克罗恩关节炎的病因尚不清楚。有细菌、病毒、真菌、原虫等感染理论;淋巴管阻塞和淋巴细胞聚集理论;炎症循环障碍理论很难得出结论。这种疾病的已得到肯定HLA-1327大多数阳性表明遗传质量是该疾病的致病因素。近年来,考虑到病理形态的多样性、疾病的慢性炎症特征、肉芽肿的存在、关节炎、皮肤损伤、免疫抑制治疗等多系统损伤,免疫控制机制障碍也是疾病的重要原因。

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