骶管囊肿是一种良性疾病，本身并不致命，但其他并发症可能是致命的，因为重症患者长期卧床，护理不到位。
骶管囊肿不是肿瘤性病变，无良恶性，不会转移。但骶管囊肿病情严重时，会压迫神经根，导致会阴区、臀部、骶尾部、小腿麻木，也可能出现排尿异常、肛周疼痛等症状。此时，药物或其他保守治疗通常效果不大，应积极进行手术治疗，通常预后较好，患者寿命基本不受影响，与普通人没有什么不同。如果患者治疗不及时，病程长，囊肿长期压迫周围神经，可导致严重并发症，如下肢麻木、弱、静脉血栓形成，如果血栓形成可能导致肺栓塞，不及时治疗，可能危及患者的生命。
因此，骶管囊肿患者应每六个月或一年进行一次复查。如果发现囊肿持续增大或病情严重，应积极手术。
