根据Leinbach诊断标准主要为：①周围血嗜酸细胞增多；②进食后会出现胃肠症状和体征；③组织学证实胃肠道嗜酸粒细胞增多或渗透。鉴于胃肠道表现缺乏特异性，诊断时应注意既往过敏史、周围血液（腹水或活组织检查）嗜酸粒细胞增多X线钡餐，纤维内镜诊断。为了早期诊断，对于无法解释的胃肠道症状，特别是有过敏性疾病史的个人或家庭吃某些食物，服用某些药物或加重胃肠道症状和体征，周围血嗜酸细胞增多，应考虑该疾病的可能性。血液、腹水发现嗜酸性粒细胞增多，纤维内镜检查病变明显充血、水肿，活检发现多个标本有更多的嗜酸细胞浸润或禁食可疑食物，糖皮质激素治疗可缓解症状，可考虑嗜酸性腹水或嗜酸性胃肠炎的诊断。
这种疾病通常由腹痛、恶心和呕吐引起，症状因病变部位而异。多为慢性经过，常有周期性发作和自发缓解的特点。
Ⅰ型：多见于30～50岁，80％有胃肠道症状。一半的患者可能患有其他过敏性疾病，如过敏性鼻炎、哮喘等。这种类型主要表现为上腹部痉挛和疼痛，伴有恶心、呕吐、腹泻等症状，发作不规律，可与某些食物有关。严重粘膜受累可引起上消化道出血、腹泻、吸收不良、肠蛋白损失、缺铁、体重减轻等。肌层受累明显可引起幽门梗阻或肠梗阻，并出现相应的症状和体征，有时误诊为Crohn腹水(称为嗜酸性腹水)或胸水发生在疾病或肿瘤浆膜受累者中。腹水通常是渗出性的。
Ⅱ型 40～60年龄更常见。这种类型有长期的胃病史，疾病更紧急，可能有上腹部痉挛性疼痛伴恶心、呕吐。消化性溃疡患者（主要是巨大的溃疡）更为常见。息肉类型，上消化道出血可以是唯一的症状。病变接近幽门会导致幽门梗阻。当病变发生在肠道时，由于肿瘤形成、肠壁增厚、水肿引起的功能障碍，可能会发生肠套叠或肠梗阻。发生在回肠部位，急性发病，可因右下腹痛、压痛、反弹痛或局部肌肉紧张而误诊为急性阑尾炎。
