1.阿米巴肠穿孔 发生率1％～4％，阿米巴尸检患者的肠穿孔率为3％～20％。急性穿孔多发生于盲肠、阑尾、升结肠，其次是直肠、乙状结肠交界处，多发生于具有急剧症状的阿米巴痢疾患者。穿孔后发生弥漫性腹膜炎，病情凶险。应及早进行手术治疗。
慢性穿孔形成局部脓肿是因为先形成粘连，穿孔后感染有限，或者穿入附近器官形成内瘘，如直肠膀胱瘘、结肠空肠瘘等。
2.阿米巴阑尾炎和阑尾脓肿 由于阿米巴肠病在盲肠中很常见，因此有更多的机会涉及阑尾。在结肠性阿米巴病的尸检病例中，发现4.0％～6.2％有阿米巴阑尾炎，有些形成脓肿或穿孔。单纯的阿米巴阑尾炎很少见。其症状与细菌性阑尾炎相似。手术中常发现病变不限于阑尾，盲肠肠壁增厚水肿。在这种情况下，阑尾残端不仅难以处理，术后也容易形成阑尾残端瘘。
慢性阿米巴阑尾炎更常见，表现为右下腹和右下腹反复压痛，或右髂窝持续不适。伴有化脓性细菌感染时，可发生急性发作。
对于疑似阿米巴阑尾炎的患者，应在手术前给予抗阿米巴药物治疗。如果贸然进行手术治疗，病变可以扩散，形成粪瘘甚至死亡。
3.阿米巴肉芽肿 病变多见于盲肠，其次是乙状结肠、降结肠和直肠。5％～10％多发性。早期无症状，病情发展后出现局限性腹痛、腹泻、发热等症状。增生的肉芽肿使肠腔变窄，可引起肠梗阻、肠套叠、大出血、肠壁穿孔或穿过腹壁形成内外瘘。除局部压痛外，还可触及硬肿块。X线钡灌肠检查显示充盈缺陷和肠绞窄。肠壁上的阿米巴脓肿和肉芽肿突入肠腔，形成锯齿状阴影。乙状结肠镜检查显示粘膜增厚，肿瘤呈葡萄状突入肠腔，附近常有散落的肉芽组织和溃疡。自溃疡底部以来，阿米巴的营养检测率较高。阿米巴肉芽肿容易被误诊为肠道肿瘤。只有在术后病理检查中发现阿米巴原虫才能确认诊断。阿米巴病经药物治疗后，应进行手术治疗。
4.结肠癌或直肠癌 慢性阿米巴肠病可能与结肠癌和直肠癌同时存在。有些人认为慢性炎症可能是由肠道刺激引起的，炎症性息肉也有利于癌症。
5.消化道出血 阿米巴顺肠长轴向两侧扩张，导致肠壁大量组织溶解，病变可深入浆膜层，腐蚀大血管，可引起大量肠出血。患者可表现为排便次数增加、血便、严重疲劳、脉冲速度、血压下降。
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