典型的志贺菌病的主要特征是急性、发热、腹痛、脓、血便，并有中度全身中毒症状。腹泻每天超过10次或更多次。重症患者伴有抽搐、头痛、全身肌肉酸痛，也引起脱水和电解质紊乱。
肠外并发症不常见。
1.菌血症 主要见于儿童，有营养不良、镰状细胞贫血及免疫功能低下患者。国外已有100多例，国内也有少数病例报道，合并菌血症者症状较严重，病死率高达46％。菌血症多见于发病后1~2天，抗生素治疗有效。
2.溶血性尿毒症综合征 主要见于痢疾志贺菌感染。有些病例一开始有类白血病反应，然后是溶血性贫血和DIC。部分病例出现急性肾衰竭，肾脏大小动脉均有血栓及肾皮质坏死，肾小球及动脉壁有纤维蛋白沉积，约半数病例鲎试验阳性，多数病例血清中免疫复合物阳性。内毒素血症可能和发病有关，但其他细菌引起的内毒素血症并无类似表现。本病预后严重。
3.关节炎 主要发生在痢疾后2周内，可能是由异常反应引起的，主要涉及大关节，可导致膝关节和踝关节肿胀和渗出。关节液中含有凝集志贺菌的抗体和血清抗体“O”价格正常。激素治疗可以迅速缓解。
