幽门梗阻可由溃疡局部炎症水肿或幽门括约肌痉挛引起，也可由溃疡修复过程中形成的疤痕引起。这两个因素可以同时存在，但主要是一个因素。一旦发生梗阻，食物和胃液就会滞留，不能通过幽门进入小肠，甚至呕吐，不仅会影响正常食物的消化吸收，还会导致大量水和电解质的异常流失，从而导致全身和局部的一系列病理和生理变化。
幽门梗阻通常是逐渐形成的，即从部分梗阻逐渐加重到完全梗阻。在梗阻的早期阶段，为了使侵蚀排入十二指肠，胃蠕动增强，胃壁肌层补偿性肥厚，但胃没有明显扩张。随着梗阻的加重，胃有强烈的蠕动。也难以克服幽门的阻力，胃逐渐扩张，蠕动减弱，胃壁松弛，胃滞留，呈袋状扩张。
