狼疮肾炎的病因尚未澄清。大多数学者认为，这种疾病是一个具有一定遗传特征的个体。在各种触发因素（如感染、物理和化学环境因素）的作用下，免疫障碍引起的自身免疫损害。具体的发病因素主要有以下几个：
一、遗传因素
遗传流行病学数据发现，该病有家庭聚集倾向，同卵双生子发病率达到25％～70％，明显高于异卵双生子。
二、环境和感染因素
1、紫外线：紫外线被认为是狼疮肾炎的病因之一。
2、药物或化学物质：一些药物可诱发自身抗体，如普鲁卡因胺、肼苯达嗪等；一些香料、染料、染发水、烟花食品、真菌也可诱发狼疮肾炎。
3、感染：近年来发现人类免疫缺陷病毒（HIV）狼疮肾炎可发生在感染者身上。血清中常见的多种病毒抗体滴度增加(如风疹、流感、麻疹等。
三、内分泌因素
狼疮肾炎患者多为女性，男女雌激素水平均升高，雄激素水平降低。
