大多数亚急性和慢性感染患者，进行性发展，急性或亚急性患者，大多数症状在2周内达到高峰，主要是脑损伤，一般有弥漫性脑损伤症状和体征，部分病例可有局灶性病变临床表现，智力障碍明显，进展为痴呆。
一、前驱症状：有些病例在发病前有上呼吸道感染或消化道症状，如头痛、微热或中度发热，有些病例体温正常，还有恶心、呕吐、腹泻等。
二、精神障碍：出现率可达81％，在疾病的各个时期，甚至构成本病的主要临床症状，精神障碍，往往与疾病高峰基本相似，程度较轻，精神障碍作为第一个症状，往往被误诊为精神疾病，因此有必要正确识别脑炎的症状。
1.意识障碍:最多见，国内报道达90％，有些是第一个症状，也可以出现在其他精神症状后，有些病例的意识总是清晰的，意识障碍嗜睡、朦胧、浊度、妄想、混乱状态，随着病情的加重，可能出现昏迷，早期意识障碍，一天轻重，病情加重，意识障碍加深和持续。
2.精神分裂症状：自言自语、联想障碍、情绪不稳定、伤人毁物等精神运动兴奋，部分患者精神活动下降、情绪冷漠、反应迟钝、懒惰、言语和活动减少甚至沉默、拒绝进食、重复和僵化的言语、顽固等，亚木僵硬或僵硬，有些在1~2天后兴奋进入僵硬，有些在僵硬状态下生病，后来发展成运动兴奋，类似于精神分裂症紧张型，言语运动兴奋类似于精神分裂症青春型，有些幻觉妄想状态，幻觉主要是幻听，个别患者内容固定，持久，甚至延迟很长时间，也可能有不固定的关系妄想、受害者妄想、疑似疾病妄想等类似的精神分裂症妄想、个别病例亚木僵硬、木僵硬状态为周期性发作。
3.智能障碍:轻度记忆障碍、注意力不集中、错构、虚构甚至严重痴呆。有些病例的记忆障碍非常突出，而且延迟很长，尤其是近记忆和机械记忆。有些人认为记忆障碍是单纯疱疹性脑炎的特征之一。
三、身体及神经系统症状及体征：神经系统症状可与前驱症状同时发生或间隔几天，或随后出现前驱症状。
中枢性面瘫、视盘水肿等脑神经损伤症状可见脑神经损伤。
在运动功能障碍中，大约有一半的患者患有癫痫，其中最常见的是大发作，其次是局灶性发作和肌肉痉挛性发作。有些患者可多种类型的发作，发病率为27％～86％，偏瘫最常见，肌张力变化的发生率达到40％～70％，大多数是锥体外系，肌肉张力增加具有易变的特点，有时隐藏，有时上肢，有时下肢，肌腱反射亢进，少数减弱，病理反射检出率50％～80％，多为双侧性，部分患者手掌反射和吮吸反射呈阳性，在疾病进展期，常出现不随意运动。
脑膜刺激征约占30％～60％，大为轻度或中度，患者颈部略有抵抗或凯尔尼格征阳性。
自主神经功能障碍和出汗增多是本病的特征性表现之一。患者经常像雨一样出汗，即使在寒冷的冬天也会出汗。出汗约占20％有的报道高达左右86％，出汗增加表明下丘脑受损，病情严重，其他唾液分泌增加，面部潮红，面部油脂增加，国内报道尿失禁更突出，尤其是尿失禁更常见30％～89％，而且是早期症状之一，临床尿失禁常表明是病毒感染伴脑炎的实质性损伤迹象，部分患者由于意识障碍无法控制尿液，但部分患者意识清晰，仍有尿失禁，属于排尿功能障碍，因此推断其病变可能影响中央小叶，少数可表现为尿潴留。
儿童病例也是分布式的，没有明显的季节性1~2周前，可有上呼吸道感染和消化道症状，昏迷、抽搐、意识障碍、抽搐、癫痫、尿失禁、出汗、脑神经损伤、肢体瘫痪、不自主运动、共济障碍、病理反射阳性、脑膜刺激阳性、儿童病毒性脑炎、意识障碍、抽搐或癫痫、阳性病理反射、脑膜刺激等全脑损伤症状。
急性单纯疱疹病毒脑炎（HSE）据报道，它是最常见的急性致死性脑炎之一10％，在坏死性脑炎中20％～75％，单纯疱疹病毒病毒性脑炎的主要原因，单纯疱疹病毒性脑炎分为Ⅰ型和Ⅱ型，Ⅱ多由生殖器粘膜感染，常见于婴儿，引起皮肤疱疹和脑炎，Ⅰ该类型从口腔黏膜感染，通过嗅觉神经和三叉神经进入大脑。病变主要是颞叶和额叶，主要是成人。
1、急性或亚急性起病，病前1～2周有感染症状或明确的病前感染史，如有呼吸道或胃肠道感染史。
2.在运动兴奋或运动抑制的同时，伴随着不同程度的意识障碍，动抑制可以逐渐加深。
3.不同病期的精神症状和神经系统体征，特别是肌肉张力增加等锥体、尿失禁等锥体外系统体征，临床表现为病毒感染引起的脑炎实质性损伤。
4.脑脊液压力和白细胞和蛋白质轻微升高或正常，但没有证据表明细菌感染（包括结核杆菌等）。
5、EEG有弥漫性异常（有些可局灶化）。
6.血清抗体滴度IgG明显增加(尤其是恢复期是急性期的4倍以上)。
7.脑脊液发现病毒抗原或特异性抗体。
