严重舌咽神经痛患者可伴有不自主咳嗽、喉痉挛、唾液分泌过多等迷走神经亢进症状；有些患者有三叉神经痛。伴有心跳暂停、昏厥、抽搐等。此外，以下疾病可能发生在本病术后：
1、术后颅内感染
该手术是一种无菌手术，严格的无菌手术是预防术后感染的最有效的措施。术前有明显感染病变的患者应推迟手术，首先清除现有感染。一旦腰部穿着明显的脑脊液有细菌感染，应根据临床判断和细菌检查选择有效的抗菌素，并使用有效的剂量治疗。
2、脑脊液漏
脑脊液泄漏是由于切口关闭不当造成的。原因是硬脑膜不易缝合紧密，乳突气房开放，骨蜡不易完全关闭气房牢固。切口脑脊液泄漏通常是皮下缝合不严格，加缝1-2针可以停止。如有脑脊液经乳突气房。-耳咽管泄漏，导致严重低颅压和头痛，需要重新开口，修复硬脑膜破口，封闭乳突气房。
3、术后颅内血肿
虽然术后硬脑膜下或小脑血肿是严重的并发症，但发病率是0.5％下面，但通常是致命的。术中岩静脉治疗不当是血肿的主要原因。岩静脉是小脑和脑干外侧的重要引流静脉。大多数患者的岩静脉切断后可以通过其他引流静脉进行补偿。然而，一些特别粗大的岩静脉患者可能会导致小脑充血性梗死和小脑血肿。岩静脉断端未得到妥善处理。当拔除气管插管、咳嗽、窒息等动作导致静脉窦压升高时，破裂出血是硬脑膜下血肿的常见原因。患者有凝血机制障碍，也可导致术后颅内血肿。术前检查必须排除此类患者。
治疗下岩静脉是预防颅内血肿的最重要措施。如果下岩静脉足够长，游离后不妨碍舌咽迷走神经的暴露，不要轻易切断。术后第一个24小时，应严格监测患者的意识状态、血压、脉搏等体征。如果麻醉停止后应清醒但未清醒，或麻醉后再次出现意识障碍，生命体征不稳定，应立即进行后颅凹陷CT扫描，及时发现颅内血肿。确认后颅凹血肿的患者应立即再次手术，清除血肿，彻底止血。
4、脑干和颅神经损伤
颅神经损伤主要与缺乏手术经验和操作错误有关。脑干损伤主要是由脑干血管损伤引起的，因此游离神经根周围的血管应温和，不得将损伤拉入脑干的小分支。
