儿童学习能力障碍的病因不明，可能与以下因素有关：
1.遗传因素。基因连锁分析提示：第15对染色体上有一个基因位点，通过常染色体显示进行遗传。一些学者利用双耳分听技术、电生理方法、皮层血流分析和半视觉来研究大脑功能，发现阅读困难的儿童有脑结构侧异常，可能是胎儿血液中睾酮水平异常引起的。
2.器质因素。有些人认为这是由内耳前庭功能障碍引起的，父母和家庭的负面生活事件会加重这些问题。
3.环境因素和营养因素。
4.其他因素。在这类儿童文字系统的处理过程中，有异常或缺陷，或识字模式和语言通路异常。
