面部畸形、额窦眶顶内侧、内眦(筛窦)或脸颊(上颌窦)肿胀。用手触摸皮肤下有光滑的肿块，就像抑制乒乓球或破蛋壳的感觉一样。当骨质受损时，可以触摸缺损的骨边，感觉肿块柔软有弹性。
额窦和筛窦囊肿可压迫眼球移位，引起眼痛、复视、流泪、眼睑下垂等症状。眼眶神经受压时眉弓麻木，鼻泪管受压时泪溢。
鼻部症状可见液体自患侧鼻腔流出。在鼻内检查过程中，鼻道肿胀或筛泡变大（即筛窦囊肿）窦囊肿）。当上颌窦囊肿时，鼻子肿胀或鼻腔外侧壁被并移位到鼻中隔。
鼻窦囊肿如感染，可形成脓性囊肿。临床症状包括发热、全身不适、头痛等中毒症状。局部表现为发红、肿胀、疼痛和压痛。
囊肿穿刺是根据患者的症状和检查进行的(穿刺方式如面部肿胀的典型部位，鼻内穿刺变大的筛泡，或下鼻道穿刺上颌窦。同时，鼻窦摄入X线片，摄片时可注入选影剂对比。应与牙源性囊肿鉴别(牙源性囊肿可见牙根尖)
