童年自闭症的病因：
1.遗传学自闭症儿童家庭中的自闭症和语言障碍患者明显高于正常人。兄弟姐妹患自闭症的风险是普通群体的50倍以上，这表明自闭症的发病与遗传有关X与综合征相关的男性疾病多于女性。最新基因探测技术的结果表明，7号染色体上的父系效应和15号染色体上的母系效应，即7号染色体和15号染色体上的父亲和母亲可能携带自闭症易感基因，该研究结果揭示了自闭症遗传原因后的可能机制。
2.围生期自闭症儿童围生期各种并发症，如产伤、宫内窒息等，明显高于正常对照组。调查发现，大多数5岁以下的自闭症儿童都有明确的脑发育迟缓相应的病因诊断，产前、产中、新生儿期的高危因素明显高于普通群体。
3.结构性脑影像技术(CT和MRI)发现自闭症儿童的大脑总体积和左右脑室体积明显大于对照组，脑干和右前扣带回的体积明显减少。
4.免疫学研究部分孤独症儿童存在T淋巴细胞数量减少辅助T细胞和B减少细胞数量，诱导抑制T细胞缺乏、自然杀伤细胞活性减低等提示孤独症与免疫系统功能异常有关。最近有人发现一些患者髓鞘基质蛋白抗体较对照组高6倍以上提示孤独症患者存在脑组织抗原细胞介导反应，即孤独症可能是一种自身免疫性疾病。
5.生化研究约1/3的患者存在5-HT功能亢进。Chugani小样本研究发现，自闭症儿童的齿状核-丘脑-5.皮质通道-HT合成异常，患者大脑中阿片含量过多，与血浆内啡肽的水平和刻板运动的严重程度有关，因为患者孤独、情绪麻木、难以建立情绪联系。
