除严重屈光不正外，晶体脱位还经常出现一些严重的并发症。
一、葡萄膜炎
它是晶体脱位的常见并发症。由晶体脱位引起的葡萄膜炎（uveitis）有两种。一种是由晶体的机械刺激引起的葡萄膜组织，另一种是脱位晶体变成过熟的白内障。产生晶体过敏性葡萄膜炎。两种葡萄膜炎都是顽固性炎症，可导致继发性青光眼。
二、继发性青光眼
它也是最常见的并发症之一。晶体进入瞳孔区域或嵌入瞳孔的玻璃疝可产生瞳孔阻滞性青光眼。反复瞳孔阻滞可使虹膜膨胀，产生无晶体眼恶性青光眼。长期晶体脱位可产生晶体溶解性青光眼。此外，眼球钝挫伤引起的晶体脱位可与虹膜根部后退和房间角分裂相结合，产生继发性青光眼。
三、视网膜脱离
晶体脱位是最常见和最严重的并发症，特别是在先天性异常的合并眼中，如Marfan综合征，甚至是双眼症。晶体脱位引起的视网膜脱位更难治疗，因为脱位的晶体往往阻碍了视网膜裂缝的准确位置和视网膜脱位的范围。如果先去除晶体，就会失去玻璃体，加重视网膜病变，延误视网膜脱位复位手术的时间。
四、角膜混浊
近年来，人们注意到晶体脱位会导致角膜混浊。晶体脱位后与角膜内皮接触，导致角膜内皮细胞损伤，导致角膜水肿混浊。
