1.消除诱因和治疗原因 积极防治口腔感染、皮肤感染、泌尿道感染、肺炎等各种感染病变，及时处理各种感染病变，手术或设备检查前应预防抗生素。心内膜炎通常发生在术后两周左右。
2.卫生教育 坚持预防为主，向群众宣传疾病的危害，并建议人们远离毒品。建议静脉药物成瘾者积极戒毒，减少心脏感染性心内膜炎的重要途径。
3.预防药物 应首先从预防菌血症开始。许多学者发现，临时菌血症经常发生在拔牙后，尤其是当患有牙周病或同时拔除多颗牙齿时。许多口腔细菌可以通过伤口进入血液，但草绿色链球菌最常见。胃肠道和泌尿生殖系统的创伤和感染往往会导致肠球菌和革兰阴性杆菌血症。葡萄球菌血症在皮肤和远离心脏的感染中很常见。因此，使用抗生素来预防这种疾病不仅要积极，而且要避免滥用。
