中医认为，远端肾小管性酸中毒病起源于内，主要与内伤因素有关。或由于先天禀赋不足，或因七种饮食疲劳，伤害肾精华，成为虚拟损伤的证据，治疗应进行诊断和治疗，具体如下：
肾精不足
治疗：补肾填精。
处方药:补天大造丸、六味地黄丸、左归丸或左归饮可加减。药用熟地、山药、山茱萸肉、枸杞、龟板、鹿角胶、杜仲、傈僳族、当归、牛膝、五味子、远志等。所有药物都可以补肾填精，增强腰膝，益智开窍。
2、脾气虚损
治法：理气健脾。
方药:用香砂六君子汤加味。药用党参、白术、茯苓、甘草、陈皮、半夏、木香、砂仁、蔻仁、菖蒲、大腹皮、通草。六君理气健脾，加蔻仁、菖蒲、大腹皮、通草，增强浑浊醒脾的力量。如果脾湿热，可以用黄连温胆汤加减。
三、胃阴亏损
治疗：滋养胃阴。
方药:用益胃汤、玉女煎或沙参麦冬汤合生脉散加减。药用太子参、麦冬、五味子、沙参、知母、百合、玉竹、生地、牛膝、天花粉、半夏、陈皮等。各种药物结合，滋阴生津益胃，滋补肾阴。
4、阴阳两虚
治疗：阴阳两补。
处方药:用金匮肾气丸或地黄饮料加减。药用熟地、麦冬、五味子、山茱萸肉、制作附件、肉桂、巴戟天、肉苁蓉、远志、菖蒲、益智仁、枸杞、刽子等。
