原发性和继发性AEF最常见的症状是胃肠道出血、腹部搏动性肿瘤、感染和体温升高。确诊为主动脉肠瘘AEF或高度怀疑该病时，应进行手术治疗。
1.术前准备：术前必须进行血液培养或感染伤口分泌物培养和药物敏感性试验，以方便术中抗生素的选择，纠正血容量和水电解质紊乱。鼻导管放入胃管减压，静脉给予广谱抗生素。一般紧急治疗后，不稳定患者应立即送往手术室进行剖腹产检查。
2、手术治疗：不进行手术治疗的主动脉肠瘘患者往往会死亡，但手术风险也很大，手术方法取决于以下具体情况。
(1)腹主动脉瘤自发性破裂者可实施Ⅰ动脉瘤切除、血管重建和十二指肠瘘修复缝合。
（2）如果没有明显的局部感染和败血症，血管重建外的吻合口损伤是原缝合线断裂，局部修复效果好。但大多数人需要将新的人工血管移植到主动脉吻合口近端的新鲜边缘(修复或切除原断裂的吻合口)。
（3）如果移植的血管感染，应通过间接人工血管旁路切除，取代腹主动脉的功能，即两侧腋窝动脉桥（人工血管）转流，或一侧腋窝动脉桥与股票动脉桥与左右动脉桥转流。主动脉的近、远两个残余端必须仔细缝合，并用大网膜覆盖，以避免破裂。手术过程中，主动脉的控制部位必须在肾动脉水平以上。如果局部有大的炎症肿块，则需要暂时切割胸部夹住主动脉，以控制出血。
3、术后处理：术后必须继续进行持续的胃肠道减压，保持良好的血液循环，注意观察下肢皮肤温度、颜色、股动脉、奈动脉和足背动脉的脉搏动。在药物敏感性试验结果后，应用广谱抗生素进行调整。注意排水物的性质和排水量。定期应用CT、MRI、超声检测新移植的人工血管或动脉残端，特别注意是否有假动脉瘤形成的迹象。
