各种尿路真菌病可有不同的并发症，如膀胱炎可见大真菌球、肉芽肿形成输尿管梗阻可出现无尿、肾盂积液等；瘘管可出现膀胱结肠瘘、尿路皮肤瘘。
1、不育：长期尿道炎症可并发前列腺炎等感染，改变前列腺液成分，导致男性不育。
2、导致阳早泄：由于疾病缠绕，各种症状和不适加重，或直接影响性生活的感觉和质量，患者逐渐出现厌恶感，导致阳痿、早泄等现象。
3、慢性肾衰：尿道炎最大的特点是容易变慢性，严重者可引起慢性肾衰竭。
4、尿道狭窄，排尿困难：由于尿道炎可直接影响尿道上皮，局部感染形成疤痕，严重时可引起尿道狭窄，使患者排尿困难。
5、引起膀胱炎、前列腺炎：前列腺、输精管、附睾前列腺、输精管、附睾和睾丸，容易引起膀胱炎、前列腺炎、尿道旁脓肿、尿道瘘等并发症。
