目前还没有足够的信息来提供每个人都接受的差异。正常尿路真菌群和真菌感染的标准。
1.尿路真菌感染的界限通常是定量培养导尿作为真菌≥1万/ml菌落数通常是真菌性尿路感染。未沉淀的新鲜导尿标本镜检查平均有1~3个真菌/10个视野HP人，相当于菌落数≥1万/ml，具有诊断意义，其正确性为80％；室温下真菌分裂繁殖缓慢，分裂期通常是5h因此，受试尿液可以在不增加真菌数量的情况下长时间放置。
2.在男性清洁中间的尿标本或女性的导尿标本中，所有阳性真菌培养都意味着尿路真菌感染。念珠菌以酵母菌和真菌丝的形式存在于尿液中。有人认为真菌丝的存在意味着入侵，但仍有争议。血清抗念珠菌抗体（血清沉淀素、凝集素等）的测定有助于诊断。肾念珠菌感染患者血清沉淀素的阳性率为83％，但有约10％的假阳性。
3.真菌性尿路感染可由血源或向上传播。如果感染仅限于泌尿系统，则多为向上。因此，真菌性阴道炎和肠道真菌感染者容易伴有尿路真菌感染。
4.膀胱镜和皮肤尿道活组织有助于诊断。
