亚临床克汀病可引起轻度智力落后、轻度神经损伤,影响大脑发育和身体发育。第二阶段对缺乏营养因素和激素(包括甲状腺功能减退)非常敏感。大量实验证实,甲状腺激素对大脑发育有一定的时间影响,在此期间,甲状腺功能减退会导致大脑发育落后,一旦这段时间补充甲状腺激素,大脑发育障碍不能纠正(不可逆转),因此这个有限的时间段也被称为大脑发育的临界时期。

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