一、非手术治疗
碘油、三氯醋酸等烧灼瘘管、电灼瘘管、盐酸奎宁均可使用，25％水杨酸钠冲洗瘘管，主要用于临时治疗不适合或暂停手术。
二、手术切除
是治疗鳃裂瘘的方法。手术方法：
1.切口:在瘘管周围做梭形切口，切开皮肤、皮下组织和颈阔肌。用组织钳抓住瘘管，沿瘘管周围向深部分离到颈动脉窦，然后在颈动脉窦处做横切口，将游离瘘管的下半部分拖出。
2、切除瘘管：将胸锁乳突肌向外拉，暴露颈动脉三角形，然后沿瘘管上半部分向深部分离，直至咽侧壁扁桃体窝。如果是第三和第四鳃裂瘘管，应沿瘘管行走分离到梨窝或食管上部。如果瘘管与咽腔相连，应立即缝合。
3.逐层缝合伤口，并置引流管。
