传统上，农民肺可分为急性、亚急性和慢性三种类型。亚急性型多为急性延迟和发展，症状严重，易误诊。然而，由于难以定义其时间和临床表现，见，一般不需要纳入常规分类。
急性型：吸入大量嗜热放线菌孢子后约4个～8h内部疾病、急性疾病、寒冷、高烧、出汗、全身不适、食欲不振、恶心、头痛、胸闷、呼吸急促、干咳或少量粘液痰，容易诊断为“感冒”，但上呼吸道症状不明显，约10％；患者可出现哮喘发作、皮肤瘙痒和粘膜水肿I类型（快速发型）异常反应症状，体检可见呼吸急促，甚至缺氧，双下肺可能闻到少量湿罗音和扭曲发音，偶尔闻哮鸣声、心率加快等，抗原接触后上述症状可在一天或几天内消失，有自愈趋势，如接触抗原可再次发生。
慢性型：反复接触大量抗原患者的病情长期无法治愈，临床上可见咳嗽、咳痰、呼吸困难、缺氧发绀、极度疲劳。继发感染者可发烧出汗，此时容易误诊为“慢性支气管炎”，体检可有肺间质纤维化体征或两肺散在湿罗音。
