根据发病机制的不同，本病的病因可分为以下三种：
1、甲状腺功能减退(甲状腺性)原发性
本型多见，约占甲减症96％。它是由甲状腺本身的病变引起的。临床上，有服用抗甲状腺药物、慢性淋巴细胞性甲状腺炎、甲亢或甲状腺癌的甲状腺切除术后、放射性碘治疗后、克汀病、舌甲状腺、侵袭性纤维性甲状腺炎、甲状腺肿物质、先天性甲状腺激素生成障碍、甲状腺转移瘤、慢性地方碘缺乏等。
2.继发性甲减(垂体性)
这种类型很少见，是由垂体疾病引起的TSH垂体肿瘤、席汉等分泌减少引起的分泌减少（Sheehan）非肿瘤选择性综合征TSH在脑垂体部位缺乏、卒中、垂体手术或放射治疗后。
3.甲状腺功能减退(下丘脑)
这种类型很少见，因为下丘脑产生促甲状腺激素释放激素（TRH）减少，使垂体TSH由于分泌减少，如鞍上肿瘤和先天性肿瘤TRH缺乏等。
