一、非手术治疗
1、溶栓与抗凝：急性肠系膜静脉血栓系膜静脉血栓形成，应立即进行抗凝治疗。溶栓治疗应在发病时间少于1周的同时进行，抗凝应主要在1周以上。早期保守治疗血栓形成，肝素(2.5～4.0)×104U/d，静脉或皮下给予；尿激酶(60～120)×104U/d或去纤酶10U/d静脉滴注可取得良好效果。对保守治疗者，抗凝治疗时间应控制在2周以内，溶栓时间应控制在2周以内5～7天。用药时，应监测患者的血小板和激活部分凝血激酶的时间，使其在用药前得到控制2～2.5两倍之间。所有患者停用肝素后，继续口服华法林3个月，高凝者需要终身抗凝。
2.补充血容量:输血和平衡液，纠正严重循环血容量不足。
3.胃肠减压。
4、抗感染：术后应使用大剂量广谱抗生素。
保守治疗期间应严密观察症状和体征变化，若患者无明显缓解或出现肠坏死表现，应立即急诊手术探查。
二、手术治疗
切除坏死肠管：与动脉闭塞不同，静脉血栓形成往往发生在外周分支而不是骨干，因此通常涉及短段肠道，因此失活的肠道一般可以切除，与端部一期一致。为了减少毒素的吸收，坏死的肠道可以在手术中首先切除。
2、静脉取栓：血栓形成的延伸通常超过肉眼可见的梗死区域。血栓经常存在于肠道膜上的静脉骨干和门静脉中，这是术后肠道坏死的重要原因。因此，肠道切除后，除了完全清除系膜残余血管中的血栓形成外，还需要在肠道膜上的静脉或门静脉上切口，以取出其中的血栓形成。
3.术中抗凝:急诊手术者应在手术中开始肝素抗凝，直至术后6～8周。Abdu复习了大量文献后，他们注意到肠切除术和抗凝治疗师的生存率是80％，单作肠切除术的生存率为50％。
