怀孕三个月不可以做无痛人流手术。

因为怀孕三个月胎儿骨骼已初步形成，体积较大，单纯使用药物无法将胎儿及其附属物排出体外，需要借助刮宫术才能完成终止妊娠的操作，而无痛人流不适用于超过12周的孕期。

如果孕妇存在子宫颈发育不良或宫颈管狭窄等特殊情况时，可能会影响人工流产操作过程中的顺利性，此时不宜采用无痛人流的方式进行处理。此外，对于有剖腹产史的患者而言，在孕中期进行人工流产后容易增加子宫破裂的风险。

总之，怀孕期间女性的身体状况较为特殊，若确实没有生育计划，应尽早与医生沟通选择合适的终止妊娠方式，以减少对身体的影响。同时还要注意术后休息，加强营养摄入，并定期复查以确保身体恢复良好。