结肠过敏的治疗不能仅仅依靠特定的中西药物来达到治疗的目的。结肠过敏的治疗关键在于解决意识形态矛盾。当疾病确诊时，应耐心细致地向患者解释疾病的性质、发病机制、病程和预防，消除各种担忧，提高治疗信心。
除严重腹痛和腹泻外，一般可以参加普通工作。加强体育锻炼，增强体质，特别是经常参加一些有益的娱乐活动，以促进神经和内脏功能的调整和修复。生活应该有规律，饮食少、清晰、易消化的食物，避免刺激性食物和强烈的调味品，如胡椒、葡萄酒、芥末油等，不要吃生、冷、油腻的食物。尽量少吸烟或不吸烟。便秘，鼓励吃多纤维蔬菜，发展定期排便规律，必要时服用一些药物对症治疗。
