HIV随着相关呼吸道感染者呼吸道症状的发生CD4+由于计数的下降和增加，临床表现缺乏诊断特异性HIV感染者的其他并发症可出现咳嗽、呼吸困难等呼吸道症状。然而，一些临床症状仍然有助于提示诊断线索。例如，咳嗽的性质需要区分是咳嗽黄脓痰还是无痰干咳。前者通常考虑细菌性肺炎，后者为卡氏肺孢子虫肺炎（PCP）多见。
发枝杆菌或真菌感染等全身性或播散性疾病提示发热和体重下降。肺外症状有助于诊断，如CD4<200/μl当患者出现呼吸系统症状和头痛时，应考虑新的隐球菌肺炎和脑膜炎。<200/μl时患者出现呼吸系统症状及头痛，应考虑新生隐球菌肺炎和脑膜炎。
HIV并发肺部感染可出现发热、心动过速、发绀、低血压，常提示其为一种急性病程（如细菌性败血症）。
