一、血象
血白细胞计数正常，重症患者可升高，血沉多增快。
二、病原学检查
病原体检查是诊断本病的可靠方法，临床诊断不常用。
1、直接涂片：涂片后用Giemsa或免疫荧光单克隆抗体染色，检测肺炎衣原体包涵体和原体，方法简单，但阳性率低。
2.组织培养方法：鸡胚卵黄囊接种由于阳性率低，可采用细胞培养方法，取咽拭子或收集下呼吸道标本，使用HEP-2细胞(喉癌细胞)或Hela229细胞培养24h，用肺炎衣原体特异性单克隆抗体染色，检测特异性包涵体，方法复杂，检测率低于其他衣原体。
三、免疫学检查
1、直接免疫荧光法：用肺炎衣原体单克隆抗体染色，直接免疫荧光法检测肺炎衣原体抗原，方法特别敏感、快速、简单。
2.微量免疫荧光（MIF）方法:检测肺炎衣原体抗体，特异性IgM滴度≥1∶16和（或）IgG≥l∶512如果双血清滴度超过4倍，可诊断急性感染，如IgM≤1∶16或IgG≤1∶512，它是以往的感染。该方法具有较高的特异性敏感性，可用于区分原发感染和再感染。它是目前最常用、最敏感的血清学方法，但应消除血液循环中类风湿因子的影响。
3.补体结合抗体检测:滴度≥l∶64急性感染可诊断为和(或)双血清滴度增加4倍以上，但不能用于早期诊断，也不能区分衣原体感染。
四、PCR法
检测肺炎衣原体DNA，据统计，敏感性较高，可与其它种衣原体区分，其特异性敏感性高于其它方法，PCR法检出率为50％～55％，直接免疫荧光法和涂片法分别为24％～27％和6％～10％，连接聚合酶链反应（LCR）根据报告，检测可以进一步提高灵敏度和检出率，但尚未应用于临床，PCR-EIA该方法是一种快速简单的酶免疫测定方法，可以改进PCR肺炎衣原体DNA扩展检测效率优于PCR培养法更好。
五、肺部X线检查
肺部X线性检查为非典型肺炎，常为单侧阶段性肺炎，病变广泛，甚至影响双肺，可伴有胸膜炎或胸腔积液。
