潜伏期长，从感染到发病一般在20年以上，多房棘球虫病病程长，具有隐袭进行性特征，早期无临床症状，仅在肝脏B超声波普查发现。
1.肝多房棘球虫病:根据临床表现，主要症状为上腹隐痛或(和)肿块：
（1）简单肝肿大：临床症状根据病变部位和大小，肝右叶顶部为易发部位，肝内侧肿胀，提高横膈膜，有时肝肋骨，腹痛可辐射到右肩背部，病变位于肝左叶，早期上腹部肿块，易发现患者一般根据病程长度，肝病变范围不同，轻一般好，重肝叶或两叶病变广泛，患者疲劳、瘦等全身症状。
(2)梗阻性黄疸型:泡球尾病变累及肝门，压迫胆总管引起梗阻性黄疸，进行性黄疸，常伴有皮肤瘙痒、食欲不振等消化道症状。
(3)巨肝结节型，或类肝癌型，主要表现为上腹部肿块，局部隆起，肝左右叶极度肿大，分别在助缘和剑突下10cm左右，硬，表面可以触及多个不同大小的结节，肝脏B超与CT扫描检查显示，肝整叶大部分受损，而另一叶代偿性显著增加，后者质较软。
2、肺多房棘球虫病：肺病变可由肝右叶病变侵蚀横膈膜至肝脏，或由血流引起，临床症状主要为少量咯血，胸部X线检查显示双肺结节性病变大小不一，0.5～1.5cm大小，多为中下部，少数患者胸部并发少量积液。
3、脑多病：主要临床症状为局限性癫痫或偏瘫，但视病变而异，颅脑CT颞叶或(和)枕叶蜂窝状低密度病度病变，脑型患者均伴有明显的肝肺多房棘球虫病。
