1、脑脊液检查：脑脊液脱落细胞学检查具有重要的诊断价值，因为这类肿瘤容易发生蛛网膜下腔扩散转移。
2、血清检查：由于肿瘤的原始胚胎特性，血清中的甲胎蛋白（AFP），绒毛膜促性腺激素（HCG）及瘤胚抗原（CEA）动态测量对疾病诊断、疗效评价和复发监测具有一定意义，CEA可略升高，AFP生殖细胞瘤、畸胎瘤、内胚窦瘤、绒毛膜癌依次升高，HCG升高由高到低依次为绒毛膜癌，生殖细胞瘤，胚胎性癌及内胚窦瘤。
3、CT：大多数肿瘤位于鞍池，略高密度肿瘤，边界清晰，质地均匀，增强扫描均匀增强，垂体瘤的区别是蝴蝶鞍不扩大；颅咽管瘤的区别在于囊钙化罕见。
4、MRI：肿瘤多表现为鞍上等T1长T2异常信号，有分儿童只能增厚垂体手柄，增强扫描明显增强，部分肿块巨大，鞍后发展，强化明显，如图1所示，MRI能更好地显示垂体手柄和正常神经垂体高信号，有助于识别诊断。
