典型的巨人症和肢端肥大症特殊，不难诊断，但一些早期或不典型的病例必须与以下疾病相鉴别。.体质高大(体质巨大) 属于正常变异，可有家族遗传史，身材高大，身体各部位发育均匀，骨龄正常，无内分泌代谢紊乱。.脑巨人症 GH肿瘤引起的巨人症应与脑巨人症相鉴别，后者较少见，出生后至4岁前生长迅速，有早熟现象，常有脑积水，智力发育不良。X线蝶鞍正常，血GH正常。 3.Marfan综合征 本病可与巨人症混淆，是先天性中胚层发育不良的疾病，30％；遗传性。它生长迅速，身高高远高于正常人，身体和手指，脚趾细长，蜘蛛，常伴有头部长、扁平足、皮脂缺乏、肌肉萎缩、半数以上晶体脱位、视网膜剥离和先天性心脏病（主要是室间隔缺损和动脉导管未关闭）。GH上升和内分泌代谢异常。.无睾巨人症 由于性腺萎缩，性功能低下，骨骺闭合晚，骨龄延迟，身材高大细长，类似巨人症，但X线蝶鞍不大，骨结构小于巨人症和肢端肥大症，指间距超过身长，GH水平正常，无内分泌变化。.皮肤骨膜增厚症 大多数年轻男性，外表类似于肢体肥大、手脚增大、皮肤增厚、毛孔增大、出汗，也可伴有非特异性关节炎。但无头部增大、蝴蝶鞍增大、压迫症状、内分泌生化代谢紊乱、血液GH、IGF-1、垂体CT等正常。
