由卡氏肺孢子菌感染引起的机会性肺孢子菌肺炎（PCP），它主要发生在早产儿、营养不良的婴儿和免疫抑制的儿童和成人。目前，世界各地都有分布式病例，中国也有一些报告。近年来，由于肾上腺糖皮质激素（以下简称激素）、器官移植后免疫抑制剂、恶性肿瘤和肿瘤化学或放疗的广泛应用，特别是自获得性免疫缺陷综合征（AIDS，艾滋病)自1981年报告以来，该病的发病率有所上升，病死率高，引起了越来越多的关注。
肺孢子菌是一种致病性低、生长繁殖缓慢的寄生原虫。健康宿主有抵抗力，只形成隐性感染。细胞免疫损伤是宿主最重要的易患因素，如营养不良、先天性免疫缺陷儿童、恶性肿瘤、器官移植或免疫抑制治疗AIDS患者。
在AIDS患者发病率高达80％～90％。当T当细胞免疫功能受到抑制时，寄生于肺泡的肺孢子虫可以大量繁殖，直接对上皮细胞造成毒素损伤，造成Ⅰ上皮屑性肺泡炎。肺泡间隔有浆细胞、单核细胞浸润、上皮增生增厚、嗜酸性泡沫物质和蛋白质渗出物。严重病例包括广泛的间质和肺泡水肿。肺泡腔充满炎症细胞、蛋白质渗出物和昆虫，阻碍气体交换，产生临床症状。
