1.常规检查 白细胞总数和中性粒细胞增加，红细胞和血红蛋白的减少因出血程度而异，血小板可以减少。肠炎患者可有血样或粘液血便。
2.细菌的分离和鉴别 取血、脓液、痰液、脑脊液、淋巴结穿刺液等材料送检。一般检查程序包括显微镜检查、培养、鼠疫噬菌体裂解试验和动物称四步试验。
3.血清学检查
①荧光抗体染色镜检查(IFA)。具有快速、敏感、特异性高的优点，但假阳性或假阴性。
②间接凝血反应(IHA)。它是将鼠疫特异性抗原（或抗体）过敏的红细胞与检测材料混合，用于检测和确定鼠疫抗体（或抗原）。它是一种快速、敏感、高特异性的血清诊断方法。它不仅可以检查活细菌和死细菌，还可以检查可溶性抗原和污染和腐败材料。20世纪70年代在中国得到了广泛的推广，是目前有效的快速诊断方法之一。
③辐射免疫沉淀试验(RIP)。敏感性和高度特异性不仅是鼠疫监测和查源的理想方法之一，也是对轻度和非典型病例的追索诊断的补充IHA的不足，具有一定的实用价值。
④葡萄球菌A改善蛋白质凝血的方法(SPA-IHA)。检出率高于间接凝血，方法简单，适用于野外基础实验。
4.聚合酶链反应(PCR)检测 是一种快速而高度特殊的诊断方法，可在几小时内进行诊断。对鼠疫监测、早期临床诊断和分子流行病学调查具有重要意义。
5.其它检测方法有ELISA放射免疫法等。
