由于免疫系统不成熟，新生儿很少接触外来抗原，免疫记忆细胞数量少，HIV感染后，免疫系统损伤严重于成人，潜伏期短，症状早，病情进展快，淋巴细胞样间质性肺炎和继发性细菌感染多。由母婴传播引起的感染儿童可在出生后几个月内出现临床迹象，从几个月到几年不等。
1. 一般临床表现为持续发热、消瘦、出生体重低、出生后体重不增加、黄疸、肝脾肿大、多部位浅表淋巴结肿大等。
2.败血症、肺炎、腹泻、尿路感染、皮肤感染、中枢神经系统感染等重复细菌感染已成为婴儿死亡的重要原因之一。
3.机会感染 持续性或反复性鹅口疮。
4.肿瘤 在成人患者中看到Kaposi肉瘤在儿童患者中很少见。
HIV急性期常无症状或症状轻微，易被忽视，必须依靠血清学检查，可使用ELISA法测血清抗HIV阳性再作等抗体Western blot测HIV如果上述检查均为阳性，可以诊断抗原HIV感染。
美国疾病控制中心认为，当儿童患有其他原因无法解释的免疫缺陷时，除了HIV抗体阳性外，可诊断出以下症状AIDS：
1.肺囊虫性肺炎。
2.弓形体脑炎或弥散性感染。
3.慢性隐孢子虫肠炎，超过1个月。
4.单纯疱疹的慢性皮肤粘膜，超过1个月。
5.巨细胞病毒感染发生在肝脏或淋巴结以外的器官。
6.进行性多灶性脑白质病。
7.念珠菌食管炎。
8.隐球菌性脑膜炎或传播性感染。
9.细胞内鸟分枝杆菌感染。
10.卡波西肉瘤(60岁以下)。
11.原发性脑淋巴细胞瘤。
12.弥散性细菌感染(不仅是肺或淋巴感染)。
