肛瘘是一种非常常见的肛肠疾病，一种是由感染因素引起的，感染的方式有很多，最常见的是细菌直接入侵引起的感染，此外，相邻器官的炎症也会引起肛瘘，如肛门湿疹。以下是肛瘘的原因：
1.肛门直肠周围的组织感染
如果肛门直肠周围炎症不能得到控制，就可能侵入到抗病能力低的组织间隙之中。
2.肛门直肠周围炎症
炎症从局部肛窝和肛瓣开始，仅限于局部炎症，并逐渐扩散。如果感染不能及时治疗，炎症可以扩散到肛门周围，形成肛门直肠周围炎症。
3.肛门直肠周围脓肿
由于肛门直肠周围组织间隙的抗病性降低，会长期成为细菌入侵、扩散、积累和繁殖的地方，导致这里的组织容易感染和炎症，形成肛门直肠周围的脓肿。
形成瘘管
肛门直肠周围脓肿自行破溃或经切开引流换药处理后，脓腔虽逐渐缩小，但溃疮却久不收口，这时腔壁已形成结缔组织增生的坚硬管道壁，中间遗留之空隙，这就是瘘道，脓液经常顺从瘘道流出，反复感染，反复发作，经久不能自愈，而成为瘘管。
如果及时治疗肛瘘，对患者的身体伤害一般较小，但由于肛瘘主要是由感染因素引起的，如果治疗不及时，很容易引起并发症，当然，并发症主要是肛肠疾病。
