吞咽困难是食管梅毒最常见的症状，多为无痛、病程长、进展缓慢，与食管癌不同。当病变进展时，进食流质也会出现吞咽困难，伴有胸骨后压迫感，可能导致体重减轻、脱水、贫血甚至严重疾病。一旦树胶样肿胀导致气管（支气管）食管瘘，每次进食时都会窒息。此外，还可能出现食管炎和梗阻的其他症状。
根据病史、实验室、X综合判断，如线、内镜活检毒治疗反应良好。X管壁僵硬、管腔狭窄狭窄，甚至梗阻，不易与癌症区分。内镜检查取决于病程和严重程度。一般有食管粘膜充血、水肿、糜烂、溃疡。有时可以看到白色斑块。有些粘膜呈颗粒状、脆性，管腔狭窄程度不同。在严重的情况下，镜管不能通过。Williams描述局部表现包括：
1.食管炎症的变化主要集中在中间。
2.粘膜纵向脱皮，可发展到上皮完全脱落。
3.白斑形成以及少数增厚的遗留上皮。
内镜检查应注意不同部位的活检，如血管周围圆形细胞浸润的病理切片和动脉内膜炎的诊断。
食管Ⅲ期梅毒非常罕见。如果确诊为阳性梅毒或梅毒血清试验，患者应考虑食管慢性梗阻。但鉴于这种特殊感染的罕见性，应首先排除其他更常见的疾病，必要时应进行抗梅毒治疗，以促进诊断。
