闭经的原因非常复杂。有些是由于内脏功能的损害和异常。有些是由于器质性病变，导致身体疾病。临床上，闭经可分为虚拟和真实两类：
(1)肝肾不足:女生闭经多由先天禀赋不足、肾气末盛、肝血不足、冲任不足引起，不能化生经血引起闭经；但女性多因产房劳累或长期疾病及肾脏，导致肾精肝血不足、冲任俱虚、子宫血溢而闭经。
(2)气血虚弱:脾胃不健康，化源不足，或饮食疲劳，过度忧虑，损伤心脾；或大病、久病、失血，或哺乳时间过长，导致营血不足，冲任血虚，无血化生闭经。
(3)阴虚血燥:素体阴虚，或失血阴虚，或长期疾病、疲劳、辛苦、干燥、阴虚生热、灼伤营阴、血海枯竭、闭经。
(4)气滞血瘀:七情内伤，气结血滞，或月经期间出生时，血室正开，外伤风寒或内伤寒冷，血冷血瘀；或邪热灼阴，阴伤涩。气滞血瘀是由于受影响，冲任瘀滞，细胞脉阻塞，导致月经水不足。
(5)痰湿阻滞:肥人多湿，脾阳失温，湿聚成痰，阻滞冲任，胞脉堵塞，经水不好。
除上述原因外，一些先天性发育异常也会导致闭经。例如，先天性无子宫、先天性子宫和阴道缺陷，或后天用药导致闭经粘连，或长期服用避孕药。
