与其他能引起相同症状的疾病相鉴别。
1.全身水肿 应与遗传珠蛋白肽合成障碍α—地中海贫血Hb Bant´s胎儿水肿和先天先天畸形，还应考虑糖尿病、先天性肾病、胎盘功能不足、胎儿输血、宫内感染等因素。
2.黄疸 生理性黄疸发生较晚，进展缓慢，程度轻，无贫血、肝脾肿大。败血症有中毒症状、发热、特异性抗体阴性、血液培养等，包括体病、毒浆虫病和颅内出血。G-6-PD其他先天性溶血性疾病，如缺乏症，应考虑鉴别。
3.贫血 主要鉴别各种原因引起的失血性贫血，G-6-PD南方常见缺乏症。其他先天性溶血性贫血和营养性贫血很少见。
