本病多见于中老年人，≥50岁者占79.2％，但在任何年龄组都可以看到。这种疾病缺乏特殊的症状和体征。听诊对诊断这种疾病没有多大帮助。只有三分之一的病例可能有心脏噪音，主要位于胸骨下缘，偶尔传导到心尖，噪音柔和。一半的病例可能会出现栓塞症状，如脑栓塞可能出现偏瘫、冠状动脉栓塞可引起心肌缺血或心肌梗死、肾动脉栓塞可引起肾绞痛等，但由于非细菌性血栓性心内膜炎的骄傲生物较小，栓塞较小，很少引起大动脉和中等动脉栓塞，主要是小动脉栓塞。因此，尽管大多数病例都有栓塞，没有症状，但许多病例在出生前无法诊断。
Mcray对非细菌性血栓性心内膜炎的临床诊断提出三联症：
1.已知可发生非细菌性血栓性心内膜炎。
2.杂音、新杂音或原杂音发生变化。
3.身体有多发性栓塞。
此外，静脉血栓形成，DIC实验室诊断和多次血液培养阴性有助于诊断非细菌性血栓性心内膜炎。如果结合UCG发现赘生物更有利于诊断。
