血液中白细胞总数增加，以中性粒细胞为主，核向左移动。脑脊液呈脓性或血性，平均白细胞数可达2780×106/L，培养无菌，但福氏耐格里阿米巴可以找到。常用的方法有:①直接涂片法：脑脊液自然沉淀后，取沉淀物涂片镜检查，仔细观察伪足运动，或固定染色后观察核的形态特征；②培养方法：将脑脊液接种1.5％在非营养琼脂上铺一层产气肠杆菌或大肠杆菌的培养基中，37℃培养3～5天观察结果;③动物接种方法：将脑脊液接种到小鼠脑，在症状发生后检查小鼠脑组织，检查是否有本虫。目前还没有适用的免疫诊断技术。
CT检查大脑中的弥漫性密度增加区域，并累及灰质。大脑和大脑脚之间的大脑池间隙闭塞，大脑半球上部周围的亚显微结构消失。
