真菌学检查。
1.直接镜检 在临床标本中可见宽大、10~15μm宽度，绝大多数无隔膜、薄壁菌丝，常呈炉根膨胀和不规则分支。刮片、痰和染色(calcofluor)观察。直接从坏死组织、痰或支气管肺泡冲洗液的临床标本中发现，毛霉比培养分离更有意义。镜下细菌和曲霉等其他真菌很容易区分。
2.真菌培养 毛霉对营养没有特殊要求，可以在不含放线菌酮的常规真菌培养基上生长。原分离培养基应含有氯霉素或庆大霉素。建议以葡萄糖为碳源，以铵或蛋白质为氮源。一般以含抗生素的沙堡琼脂为原分离培养基，以土豆琼脂为菌种保存鉴定。硫胺是一些菌种唯一需要的生长因素，如伞枝犁头霉。大多数毛霉目产孢子丰富，生长迅速。整个培养基可以在几天内填满并推开盖子。然而，一些菌种，如优雅的节壶霉和脉管状瓶霉，相对难以识别，因为大多数原始分离不能产生孢子，需要代替土豆葡萄糖琼脂。孢子产生可刺激营养缺陷的培养基，如玉米粉葡萄糖蔗糖酵母提取物琼脂。
沙堡琼脂上的菌落呈黄色至灰色，边缘有限，外观薄，蜡状光泽，上面有放射性沟纹。接合孢子典型培养10天左右，壁光滑，可见接合孢子产生的菌丝形成的龟嘴状结构。随着时间的推移，可以看到更多的20~40μm厚壁孢子的大小。分生孢子梗上的分子孢子直接产生次生孢子。
组织病理学：由于患者免疫力低下，毛霉感染的组织病理学没有明显的特异性，常有水肿和中性粒细胞浸润，炎症反应罕见强烈。可见宽丝带样菌丝，直径7~15µm，直角分叉具有诊断价值。细菌没有分离或很少分离。有时，由于壁薄，细菌可以扭曲和折叠，似乎有许多分离。有时细菌不宽，但仍有直角分支。偶尔会看到厚壁孢子。血管经常被细菌侵入，导致邻近组织坏死。其他组织的病理变化还包括伴急性和慢性浸润性坏死，并涉及血管。血管浸润常导致血栓形成、阻塞和血管坏死。有时，孢子囊中轮廓清晰的小柱孢子孢子可以在通风良好的鼻肺组织中看到。
近几年才会CT、磁共振、细针吸收等技术应用于诊断系统性或鼻脑毛霉感染，并采用间接酶联吸附试验进行病原学检测，但仍需积累经验。
