1.化脓性并发症 感染直接侵入邻近组织器官或扩散到管腔。这种并发症在儿童中更为常见，包括化脓性颌下或颈部淋巴结炎、化脓性中耳炎、乳突炎、鼻窦炎、扁桃体周脓肿、咽后壁脓肿等。链球菌通过筛板扩散，导致脑膜炎、脑脓肿和颅内静脉窦栓塞。A目前，由组链球菌引起的肺炎、肺脓肿、纵隔炎和心包炎很少见。
2.迁移性并发症 化脓性关节炎、心内膜炎、脑膜炎或脑脓肿、骨髓炎和肝脓肿可通过细菌血源性传播产生。目前，这种并发症在有效抗菌药物治疗以来一直很少见。
3.链球菌引起的非化脓性并发症 变态反应性疾病，包括风湿热和急性肾小球肾炎。
除某些“皮肤”型菌株外，A组链球菌可引起风湿热，一般发生在急性扁桃体炎或咽峡炎后3周，但也发生在2~3天，约1个月。扁桃体炎和猩红热患者风湿热的发病率约为2.8％。丹毒后风湿热发病率不明，脓疱疮后风湿热不发生，但可引起肾小球肾炎。
链球菌感染后第三周出现急性肾小球肾炎。A组链球菌的某些型别感染与肾炎发病有关，如呼吸系感染菌12型以及致脓疱疮的49型均为引起肾炎的常见菌株，其他尚有1、4、25、55、57、60和61型等。在可引起肾小球肾炎的链球菌感染中，并发该病者可达10％～15％。
