肺炎通常被其他严重的全身症状所掩盖，无论是先天性还是后天性巨细胞包含体病。新生儿巨细胞肺炎可表现为持续性呼吸窘迫，但常有肝脾肿大、黄疸、紫癜和中枢神经系统损伤。患者出生几个月后，肺炎也可合并肝脾增大，有时并发卡氏肺囊虫肺炎。肺部症状与其他非细菌性肺炎相似，包括咳嗽、呼吸困难、发绀和三凹征。听诊多无异常，与肺部相似X线变化不平行。X线胸片可见广泛的索条状纹理增粗和小叶性炎症浸润灶，呈网点状阴影。患儿有病毒血症时，出现肝大和肝功能低下等慢性肝炎的表现。巨细胞病毒引起的单核细胞增多症难以与EBV传染性单核细胞增多的鉴别。 该病缺乏独特的临床表现，常需病毒学和血清学的诊断方法。
1.病原学检查 人类胚胎肺成纤维细胞可以从患者的呼吸道分泌物和尿液培养中分离出巨细胞病毒。尿沉渣涂片后，可以找到包含体的巨细胞。分子生物学技术：聚合酶链反应(PCR)方法直接检测巨细胞病毒DNA，与病毒分离相比，具有快速、特异、敏感等优点，已应用于早期快速诊断。 HCMVpp65检测：HCMVpp65是HCMV晚期抗原，HCMVpp65抗原血症是活性的HCMV感染的重要标志。检测方法是用单克隆抗体技术和免疫染色法直接检测感染细胞HCMV编码的蛋白质。该方法诊断活动HCMV敏感性和特异性感染≥90％。
2.血清学检查 抗体滴度可以通过应用免疫荧光、间接血凝抑制和补体结合来增加。间接免疫荧光试验、免疫酶染色和酶联免疫吸附试验(ELISA)测抗CMV-IgG和IgM抗体，CMV-IgM抗体阳性表示近期感染，具有诊断价值。CMV-IgG抗体阳性表示既往感染，急性和恢复期双血清CMV-IgG当抗体效率上升4倍或4倍以上时，具有诊断意义，表示近期感染。
